Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3T2

9130213A22Rik, RIKEN cDNA 9130213A22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130213A22RikQ3V3T2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9130213A22RikQ3V3T2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9130213A22RikQ3V3T2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms