Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC051142Q3V0M8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC051142Q3V0M8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms