Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3V0E1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3V0E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3V0E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3V0E1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3V0E1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3V0E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3V0E1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3V0E1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms