Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Usp48Q3V0C5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp48Q3V0C5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms