Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BB287469Q3UT53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BB287469Q3UT53 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms