Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfswapQ3USH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfswapQ3USH5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SfswapQ3USH5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms