Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtl4Q3URY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtl4Q3URY0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtl4Q3URY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms