Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkain3Q3URJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms