Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrc4Q3UP24 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc4Q3UP24 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms