Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc33Q3ULW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc33Q3ULW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc33Q3ULW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms