Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc34Q3UI66 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc34Q3UI66 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms