Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lmod2Q3UHZ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lmod2Q3UHZ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmod2Q3UHZ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms