Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr41Q3UDP0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr41Q3UDP0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms