Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops9Q3U898 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cops9Q3U898 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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