Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk3Q3U3Q1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ulk3Q3U3Q1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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