Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vars2Q3U2A8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vars2Q3U2A8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vars2Q3U2A8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms