Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March9Q3TZ87 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March9Q3TZ87 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March9Q3TZ87 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.8 ms