Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrx1Q3TL44 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrx1Q3TL44 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrx1Q3TL44 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms