Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam47cQ14BE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam47cQ14BE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam47cQ14BE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms