Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VgfQ0VGU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VgfQ0VGU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VgfQ0VGU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VgfQ0VGU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms