Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfdp1Q08639 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfdp1Q08639 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfdp1Q08639 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms