Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnma1Q08460 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnma1Q08460 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnma1Q08460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms