Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gdf9Q07105 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdf9Q07105 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf9Q07105 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.3 ms