Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scg2Q03517 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scg2Q03517 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms