Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkp1P97350 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkp1P97350 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp1P97350 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.9 ms