Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh8P97291 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh8P97291 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh8P97291 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh8P97291 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh8P97291 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh8P97291 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh8P97291 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms