Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TnikP83510 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnikP83510 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnikP83510 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnikP83510 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TnikP83510 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TnikP83510 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnikP83510 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnikP83510 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnikP83510 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TnikP83510 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnikP83510 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnikP83510 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnikP83510 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TnikP83510 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TnikP83510 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TnikP83510 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnikP83510 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnikP83510 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnikP83510 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnikP83510 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnikP83510 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnikP83510 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnikP83510 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnikP83510 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnikP83510 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnikP83510 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnikP83510 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnikP83510 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TnikP83510 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TnikP83510 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TnikP83510 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnikP83510 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnikP83510 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnikP83510 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnikP83510 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnikP83510 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnikP83510 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnikP83510 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnikP83510 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TnikP83510 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TnikP83510 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnikP83510 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnikP83510 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnikP83510 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnikP83510 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnikP83510 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnikP83510 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnikP83510 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnikP83510 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnikP83510 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnikP83510 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms