Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otx1P80205 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Otx1P80205 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otx1P80205 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx1P80205 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms