Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifap3P70188 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kifap3P70188 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kifap3P70188 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms