Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sumo1P63166 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms