Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpeP62305 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms