Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd6P61407 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd6P61407 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms