Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Smg6P61406 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smg6P61406 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smg6P61406 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smg6P61406 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smg6P61406 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.3 ms