Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lman2lP59481 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lman2lP59481 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2lP59481 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms