Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1P56183 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1P56183 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rrp1P56183 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms