Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PltpP55065 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PltpP55065 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PltpP55065 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PltpP55065 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PltpP55065 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PltpP55065 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PltpP55065 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PltpP55065 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PltpP55065 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PltpP55065 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PltpP55065 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PltpP55065 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PltpP55065 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PltpP55065 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PltpP55065 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PltpP55065 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PltpP55065 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PltpP55065 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PltpP55065 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PltpP55065 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PltpP55065 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PltpP55065 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PltpP55065 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PltpP55065 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PltpP55065 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PltpP55065 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PltpP55065 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PltpP55065 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms