Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.7 ms