Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp1P52624 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp1P52624 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upp1P52624 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms