Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod1P49813 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod1P49813 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms