Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkn1bP46414 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn1bP46414 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn1bP46414 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms