Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NodalP43021 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NodalP43021 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NodalP43021 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NodalP43021 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NodalP43021 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NodalP43021 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NodalP43021 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NodalP43021 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NodalP43021 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NodalP43021 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NodalP43021 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NodalP43021 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NodalP43021 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NodalP43021 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NodalP43021 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NodalP43021 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NodalP43021 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NodalP43021 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NodalP43021 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NodalP43021 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NodalP43021 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NodalP43021 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NodalP43021 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NodalP43021 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NodalP43021 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NodalP43021 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NodalP43021 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NodalP43021 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NodalP43021 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms