Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc10P31257 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc10P31257 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc10P31257 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms