Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VtnP29788 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VtnP29788 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VtnP29788 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VtnP29788 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VtnP29788 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VtnP29788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VtnP29788 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VtnP29788 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VtnP29788 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VtnP29788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VtnP29788 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VtnP29788 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VtnP29788 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VtnP29788 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VtnP29788 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VtnP29788 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VtnP29788 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms