Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp1P29452 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp1P29452 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp1P29452 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp1P29452 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp1P29452 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp1P29452 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp1P29452 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp1P29452 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms