Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprmP28828 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprmP28828 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprmP28828 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PtprmP28828 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprmP28828 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprmP28828 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtprmP28828 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PtprmP28828 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PtprmP28828 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
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