Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb7P26011 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms