Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd12P23812 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd12P23812 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd12P23812 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.3 ms