Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm3P21107 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3P21107 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3P21107 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms