Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcer1aP20489 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcer1aP20489 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms