Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NelfeP19426 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
NelfeP19426 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NelfeP19426 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NelfeP19426 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NelfeP19426 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NelfeP19426 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NelfeP19426 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NelfeP19426 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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